质谱技术的快速发展随之产生了更为复杂的质谱数据,其应用领域广泛,包括但不限于医学、食品、药品、化妆品等的研发与检测。然而在蛋白组学数据的分析挖掘方面,不少相关从业者缺乏真正深入、系统的学习机会。特别是蛋白质组学已经开始进入大数据时代,众多研究者在面对海量质谱数据的分析时往往会感到无可奈何!!!为了让大家更好地理解蛋白质谱数据,并从中获取更深入的信息,豆谷科技将基于蛋白质组学领域知名质谱数据分析软件平台--PEAKS Studio & PEAKS Online,于2022年4月13日举办一场在线培训班。
质谱的技术发展,极大程度地推动了蛋白质组学的发展。无论是单个蛋白的表征、单细胞蛋白质组,还是到大规模的临床蛋白质组学,离不开多属性的质谱方法和对应的数据分析。本届蛋白质谱数据分析培训班将由豆谷科技与中国质谱学术大会组委会联合举办,旨在从质谱方法及数据分析,到最新的蛋白组学的应用,为从事蛋白组学的科研人员和学生提供一个学习和交流的平台,诚挚地邀请您的参与 !
肿瘤细胞的遗传不稳定性往往导致大量突变的发生,其中非同义突变的表达可以生成肿瘤特异性蛋白,这些蛋白即为新生抗原(Neoantigen)。肿瘤新生抗原在正常细胞中不表达,具有高度的免疫原性。新生抗原被内源性蛋白酶体(proteasome)降解为8-11个左右氨基酸的短肽,肽段与MHC-I类分子特异性结合,然后被呈递至癌细胞表面,被免疫系统T细胞识别,激活T细胞,进而使得癌细胞被效应T细胞攻击和消除。
5月10日—11日,首届中国生物计算大会暨数字医学创新峰会在苏州国际博览中心召开。会议集聚了国内外生命科学和计算领域顶尖专家,BSi的创始人,加拿大皇家科学院院士,滑铁卢大学计算机学院李明教授受邀参加并在大会上做了应用深度学习方法对抗原抗体测序的报告。
近日,滑铁卢大学计算机科学学院的研究人员成功应用机器学习来识别肿瘤特异性抗原,这将帮助个性化癌症疫苗更准确实施。在一次专访中,研究人员为大家详细介绍了这一方法原理及应用前景。
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SARS-CoV-2引起的COVID-19(新冠肺炎)不仅仅影响了全中国人民的生产生活,也是人类命运共同体所面临的一个新挑战。Bioinformatics Solutions Inc.是由一群以华人科学家为主导的算法团队,在质谱数据分析领域拥有多年的经验积累,为快速发展蛋白质组学以及生物药行业提供了相关的算法和软件解决方案,上海豆谷信息科技作为BSI在中国的合作伙伴,在这个特殊时期,我们希望能够联手为国内的抗疫战斗做一些力所能及的工作。
2019年12月2日-3日,由豆谷科技与PEAKS算法的开发者Bioinformatics Solutions Inc联合举办的首届PEAKS中国用户会暨第四届PEAKS蛋白质组学培训班在上海好望角大酒店五楼长恭厅举办。本次用户大会邀请了业内知名的来自北大医学部的黄超兰教授,中国农业科学院蜜蜂研究所的李建科教授,以及复旦大学的乔亮教授作为PEAKS资深用户分享了他们的工作、研究经验及与PEAKS携手科研的故事。同时,豆谷科技也特别邀请了PEAKS算法的开发者——加拿大皇家科学院院士、滑铁卢大学的李明教授分享了他们AI团队前沿的算法应用,以及如何将计算机科学与生命科学相结合来解决问题。此外,BSI的CEO单宝珍博士和豆谷科技的高级应用工程师李文婷,分别为与会人员详细讲述了PEAKS软件的算法、应用和本地部署、云计算方案等内容。
从PEAKS X版本到PEAKS X+,我们实现了用于基于任何类型LC-MS/MS的蛋白质组学数据完整分析工作流,所有的功能都在一个软件平台中得以应用。在PEAKS X中,我们已经加入了对DIA和离子淌度数据的支持。而在PEAKS X+中,用户将获得所有类型数据的分析。